Device Studio(簡稱:DS)作為鴻之微的材料設(shè)計與仿真軟件,能夠進行電子器件的結(jié)構(gòu)搭建與仿真;能夠進行晶體結(jié)構(gòu)和納米器件的建模;能夠生成科研計算軟件 Nanodcal、Nanoskim、MOMAP、RESCU、DS-PAW、BDF、STEMS、TOPS、PODS、VASP、LAMMPS、QUANTUM ESPRESSO、Gaussian的輸入文件并進行存儲和管理;可以根據(jù)用戶需求,將輸入文件傳遞給遠程或本地的計算機進行計算,并控制計算流程;可以將計算結(jié)果進行可視化顯示和分析。
上一期的教程給大家介紹了Device Studio應(yīng)用實例之DS-PAW應(yīng)用實例下半部分的內(nèi)容,本期將介紹Device Studio應(yīng)用實例之BDF應(yīng)用實例上半部分的內(nèi)容。
8.11.BDF實例
BDF(Beijing Density Functional)是一個獨立完整、具有完全自主知識產(chǎn)權(quán)的量子化學(xué)計算軟件包。也是國際上第一個基于現(xiàn)代密度泛函理論、能準確計算分子體系基態(tài)總能量的完全相對論密度泛函程序(早期的類似程序因數(shù)值積分精度太差不能準確計算總能量)。
BDF官方用戶手冊網(wǎng)址為:https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/index.html
BDF的研發(fā)團隊信息:
-
國際量子分子科學(xué)院院士劉文劍研發(fā)團隊.
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鴻之微研發(fā)團隊、服務(wù)團隊。
圖8.11-1: BDF軟件特色圖
BDF軟件特色:
1.高精度相對論方法。 2.任意點群對稱性。 3.自下而上自洽場方法。 4.高效軌道局域化。 5.亞線性標度含時密度泛函方法。 6.亞線性標度化學(xué)位移計算方法。7.自旋匹配開殼層含時密度泛函方法。
8.基態(tài)與激發(fā)態(tài)旋軌耦合計算。
9.基態(tài)——激發(fā)態(tài)以及激發(fā)態(tài)——激發(fā)態(tài)非絕熱耦合矩陣元。 10.化學(xué)結(jié)構(gòu)和反應(yīng)路徑優(yōu)化。以基態(tài)分子CH2S完成sf-X2C/TDDFT-SOC的自旋軌道耦合計算為例來詳細描述 BDF 在Device Studio中的應(yīng)用。
8.11.1.BDF的發(fā)展史
BDF 的研發(fā)始于1993年,并于1997年正式命名。最初的想法是對稀土、錒系、過渡金屬、超重元素等小分子體系進行高精度計算,考察這些體系中的相對論效應(yīng),因此一開始就采用基于Dirac算符的完全相對論密度泛函理論(4C-DFT)和近乎完備的基函數(shù)“數(shù)值基+STO”(Slater-type orbital)。正因為如此,BDF對稀土、錒系、超重元素的計算結(jié)果一直被作為檢驗其他近似相對論方法的基準。BDF對重元素體系電子、分子結(jié)構(gòu)的計算結(jié)果被后續(xù)20余個實驗驗證。
2009年開始引入基于高斯基的解析積分,BDF 進入一個新的發(fā)展階段。
毋庸諱言,BDF 一開始就定位于發(fā)展新理論、新方法和新算法的平臺,因此是一款“科研軟件”?;?BDF 發(fā)展的理論和方法包括:相對論含時密度泛函理論(4C/ZORA/X2C-TDDFT)、精確二分量(X2C)相對論理論、準四分量(Q4C)相對論理論、自旋分離的X2C相對論理論(sf-X2C+so-DKHn)、多體有效量子電動力學(xué)(eQED)、相對論核磁理論(4C/X2C-NMR)、相對論核自旋-轉(zhuǎn)動理論(4C-NSR)、相對論能帶理論(X2C-PBC)、X2C解析梯度和Hessian;激發(fā)態(tài)HF/KS方法(mom);基于“用分子片合成分子”(F2M)思想的軌道局域化方案(FLMO)、亞線性標度含時密度泛函理論(FLMO-TDDFT)、亞線性標度NMR方法(FLMO-NMR)、迭代軌道相互作用“自下而上”自洽場方法(iOI);自旋匹配開殼層含時密度泛函理論(SA-TDDFT)、自旋反轉(zhuǎn)含時密度泛函理論(SF-TDDFT)、基態(tài)/激發(fā)態(tài)-激發(fā)態(tài)非絕熱耦合含時密度泛函理論(NAC-TDDFT)、含時密度泛函理論解析能量梯度、任意單值/雙值點群對稱化等。
除了上述相對論/非相對論密度泛函、含時密度泛函理論,BDF還有基于“先靜態(tài)再動態(tài)又靜態(tài)”(SDS)思想的波函數(shù)電子相關(guān)方法SDSPT2SDSCI、iCI、iCIPT2、iCAS、iCISCF、SOC-iCI、iCI-SOC,以及直接求解大矩陣內(nèi)部本征態(tài)的iVI方法等等。
鑒于BDF的現(xiàn)狀,首期商業(yè)化版本將以熒/磷光材料發(fā)光機理和材料設(shè)計為主要應(yīng)用目標,因此不包括4C/X2C相對論、波函數(shù)電子相關(guān)、固體能帶/核磁等方法。即首期商業(yè)化的BDF將以DFT、TDDFT為主,包括基態(tài)與激發(fā)態(tài)KS、QM/MM、FLMO-TDDFT、SF-TDDFT、NAC-TDDFT、sf-X2C-SA-TDDFT/SOC、SA-TDDFT解析能量梯度和數(shù)值Hessian、穩(wěn)定結(jié)構(gòu)和過渡態(tài)優(yōu)化、反應(yīng)路徑優(yōu)化、隱式溶劑化模型、FLMO-NMR、基于局域軌道(FLMO)的性質(zhì)計算和分析等特色功能。
8.11.2.BDF計算流程
BDF在Device Studio中的計算流程如圖8.11-2所示。
圖8.11-2: BDF計算流程
8.11.3.BDF創(chuàng)建項目
雙擊Device Studio圖標快捷方式,登錄并啟動Device Studio,在創(chuàng)建或打開項目界面中(圖5.1-1: 啟動軟件后選擇創(chuàng)建或打開項目的圖形界面),根據(jù)界面提示選擇創(chuàng)建一個新的項目(Create a new Project)或打開一個已經(jīng)存在的項目(Open an existing Project)的按鈕,選中之后點擊界面中的OK按鈕即可。若選擇創(chuàng)建一個新的項目,用戶可根據(jù)需要給該項目命名,如本項目命名為BDF
,或采用軟件默認項目名。
8.11.4.BDF導(dǎo)入結(jié)構(gòu)
在Device Studio的圖形界面中點擊File→Import→Import Local, 則彈出導(dǎo)入BDF結(jié)構(gòu)文件的界面,根據(jù)界面提示找到CH2S.hzw
結(jié)構(gòu)文件的位置,選中CH2S.hzw
結(jié)構(gòu)文件,點擊打開按鈕則導(dǎo)入CH2S.hzw
結(jié)構(gòu)后的Device Studio界面如圖8.11-3所示。在Device Studio中導(dǎo)入結(jié)構(gòu)的其他方法這里不做詳細說明,用戶可參照導(dǎo)入結(jié)構(gòu)節(jié)內(nèi)容。
圖8.11-3: 導(dǎo)入CH2S.hzw
結(jié)構(gòu)后的Device Studio圖形界面
審核編輯:湯梓紅
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計算機
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原文標題:產(chǎn)品教程|Device Studio應(yīng)用實例19(BDF)
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