資料介紹
阿爾茨海默癥(Alzheimer’s disease, AD)基因表達譜數(shù)據(jù)具有高維性、高噪聲、高冗余性等特點,使得AD特異性基因的搜索空間巨大,搜索算法時間長,降低了算法的挖掘性能及其生物學分析。因此對其基因表達譜數(shù)據(jù)進行去噪和降維預處理是十分必要的。文中首先利用小波包變換-SAM方法對數(shù)據(jù)進行降維去噪,實驗結(jié)果證明了小波包方法能較好地提取基因表達譜有用信息;然后應用快速獨立成分分析(FastICA)算法對預處理后的數(shù)據(jù)進行矩陣分解分析,并根據(jù)獨立分量選取特異性基因。在此基礎(chǔ)上的樣本分類實驗表明,F(xiàn)astICA提取的特異性基因具有較高的顯著性,能夠提高樣本的分類結(jié)果。同時,通過所提取特異性基因的富集性分析,文中給出了這些基因在阿爾茨海默癥數(shù)據(jù)集中聚類情況及其基因表達情況,為AD的生物學及醫(yī)學病理分析提供有利的依據(jù)。
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